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.. _guide_cn-nn-heterograph:
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3.3 异构图上的GraphConv模块
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:ref:`(English Version) <guide-nn-heterograph>`
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DGL提供了 :class:`~dgl.nn.pytorch.HeteroGraphConv`,用于定义异构图上GNN模块。
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实现逻辑与消息传递级别的API :meth:`~dgl.DGLGraph.multi_update_all` 相同,它包括:
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- 每个关系上的DGL NN模块。
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- 聚合来自不同关系上的结果。
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其数学定义为:
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.. math:: h_{dst}^{(l+1)} = \underset{r\in\mathcal{R}, r_{dst}=dst}{AGG} (f_r(g_r, h_{r_{src}}^l, h_{r_{dst}}^l))
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其中 :math:`f_r` 是对应每个关系 :math:`r` 的NN模块,:math:`AGG` 是聚合函数。
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HeteroGraphConv的实现逻辑
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~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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.. code::
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import torch.nn as nn
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class HeteroGraphConv(nn.Module):
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def __init__(self, mods, aggregate='sum'):
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super(HeteroGraphConv, self).__init__()
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self.mods = nn.ModuleDict(mods)
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if isinstance(aggregate, str):
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# 获取聚合函数的内部函数
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self.agg_fn = get_aggregate_fn(aggregate)
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else:
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self.agg_fn = aggregate
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异构图的卷积操作接受一个字典类型参数 ``mods``。这个字典的键为关系名,值为作用在该关系上NN模块对象。参数 ``aggregate``
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则指定了如何聚合来自不同关系的结果。
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.. code::
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def forward(self, g, inputs, mod_args=None, mod_kwargs=None):
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if mod_args is None:
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mod_args = {}
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if mod_kwargs is None:
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mod_kwargs = {}
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outputs = {nty : [] for nty in g.dsttypes}
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除了输入图和输入张量,``forward()`` 函数还使用2个额外的字典参数 ``mod_args`` 和 ``mod_kwargs``。
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这2个字典与 ``self.mods`` 具有相同的键,值则为对应NN模块的自定义参数。
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``forward()`` 函数的输出结果也是一个字典类型的对象。其键为 ``nty``,其值为每个目标节点类型 ``nty`` 的输出张量的列表,
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表示来自不同关系的计算结果。``HeteroGraphConv`` 会对这个列表进一步聚合,并将结果返回给用户。
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.. code::
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if g.is_block:
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src_inputs = inputs
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dst_inputs = {k: v[:g.number_of_dst_nodes(k)] for k, v in inputs.items()}
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else:
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src_inputs = dst_inputs = inputs
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for stype, etype, dtype in g.canonical_etypes:
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rel_graph = g[stype, etype, dtype]
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if rel_graph.num_edges() == 0:
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continue
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if stype not in src_inputs or dtype not in dst_inputs:
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continue
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dstdata = self.mods[etype](
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rel_graph,
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(src_inputs[stype], dst_inputs[dtype]),
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*mod_args.get(etype, ()),
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**mod_kwargs.get(etype, {}))
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outputs[dtype].append(dstdata)
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输入 ``g`` 可以是异构图或来自异构图的子图区块。和普通的NN模块一样,``forward()`` 函数需要分别处理不同的输入图类型。
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上述代码中的for循环为处理异构图计算的主要逻辑。首先我们遍历图中所有的关系(通过调用 ``canonical_etypes``)。
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通过关系名,我们可以使用g[ ``stype, etype, dtype`` ]的语法将只包含该关系的子图( ``rel_graph`` )抽取出来。
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对于二分图,输入特征将被组织为元组 ``(src_inputs[stype], dst_inputs[dtype])``。
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接着调用用户预先注册在该关系上的NN模块,并将结果保存在outputs字典中。
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.. code::
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rsts = {}
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for nty, alist in outputs.items():
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if len(alist) != 0:
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rsts[nty] = self.agg_fn(alist, nty)
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最后,``HeteroGraphConv`` 会调用用户注册的 ``self.agg_fn`` 函数聚合来自多个关系的结果。
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读者可以在API文档中找到 :class:~dgl.nn.pytorch.HeteroGraphConv 的示例。 |